1.成雞與雛雞分開喂養，以免帶蟲的成年雞散播病原導致雛雞爆發球蟲病。
　　2.保持雞舍干燥、通風和雞場衛生，定期清除糞便，并堆放發酵以殺滅卵囊。保持飼料、飲水清潔，籠具、料槽、水槽定期消毒，一般每周一次，可用沸水、熱蒸氣或3%~5%的熱堿水等處理。補充足夠的維生素K和給予3~7倍推薦量的維生素A，可加速雞患球蟲病后的康復。
　　3.雛雞在3~4周齡之內，選用鏈霉素、土霉素等藥物預防白痢病，同時也預防了球蟲病。
　　4.終身給予預防藥物，常用莫能霉素、鹽霉素、奈良菌素、尼卡巴嗪、馬杜拉霉素、硝苯酰胺、氯苯胍、地克珠利等，主要用于肉雞。
　　5.人工免疫，大量的研究試驗及生產實踐都已證明，雞只重復感染球蟲2~3次后，即可產生堅強的抗球蟲免疫保護力，從而使雞只免受球蟲病的侵害。因此，通過疫苗免疫預防球蟲病是安全可行的。國外已有多種商品化球蟲疫苗上市供應，并且在許多養雞業先進的國家獲得廣泛應用，目前我國商品化的疫苗也已研制成功，因此，疫苗預防將會逐漸發展為防治雞球蟲病的主要手段之一。雞球蟲疫苗的大量推廣使用，將為養雞業的發展帶來顯著的經濟效益、社會效益和生態效益。