據中國農業科學院蘭州獸醫研究所研究員劉湘濤介紹，口蹄疫病毒到目前已確定了7個血清型：O、A、C、SAT1、SAT2、SAT3和AsiaI型?？谔阋卟《镜难逍吞攸c為該病的防疫工作帶來了困難。
　　根據農業部的消息，我國暴發的口蹄疫主要以O型為主，目前國內普免的疫苗也以O型為主。而自從2013年我國廣東茂名暴發A型口蹄疫案例以來，A型口蹄疫逐步成為養豬人士擔心的又一疫病。根據OIE的數據顯示，2013年全球A型口蹄疫異?；钴S，A型口蹄疫流行范圍進一步擴大，成為2013年流行的主導血清型。
　　“豬場沒必要免疫A型口蹄疫疫苗。”茂名某規?；i場老板陳明俊(化名)告訴南方農村報記者，理論上，雖然A型和亞洲1型口蹄疫病毒感染均可引起豬發病，但從我國幾十年有記載的口蹄疫流行歷史來看，豬口蹄疫最常見的仍是O型。個別年份雖偶爾出現A型或亞洲1型流行的情況，但流行的范圍都非常小，發病也都是以散發為主，而且經過選用相應血清型疫苗緊急免疫，疫情亦很容易快速被控制，對于發病豬場而言，實質性影響其實非常有限。因此，我國養豬業仍應以O型口蹄疫為主。如果把A型和亞洲1型也納入日常生產免疫預防計劃，口蹄疫的免疫預防工作量勢必非常大，得不償失。
　　而據業內資深行業人士透露，目前我國還沒有豬用A型口蹄疫的疫苗，也尚未正式許可在豬群上使用A型口蹄疫疫苗。為提高口蹄疫疫苗的效率，國家強制免疫用口蹄疫疫苗將逐步執行新的疫苗質量標準。“基本上按照新標準執行后，口蹄疫疫苗的產品質量能夠得到大幅度提升，養殖戶不必太擔憂個別血清型的暴發情況。”
免疫前將疫苗恢復到室溫
　　雖然目前不少養殖戶都會普免O型口蹄疫疫苗，但免疫失敗的案例比比皆是。“防控口蹄疫，不要總拿疫苗無用、病毒變異說事。”湖南農大動物藥業技術總監朱中平認為，目前有國家批文的口蹄疫疫苗是有效的，豬場口蹄疫是完全可以預防控制。之所以會出現出欄時疾病易發情況，是因為養戶免疫程序出現了問題，或是豬群免疫密度沒有達到80%以上，或是沒有注意觀察免疫前后豬群的健康狀況。“健康狀況不好的豬群，不僅嚴重影響疫苗免疫效果，而且有可能導致亞臨床感染豬群因注射疫苗應激而暴發疾病。”
　　防控口蹄疫除免疫程序外，免疫操作一定要規范。據廣東省農業科學院動物衛生研究所杜偉賢介紹，在疫苗使用前，要等疫苗恢復到室溫之后再使用，以減少應激反應；其次，疫苗要充分搖勻，在疫苗使用中，要避免高溫和日照，疫苗打開后要在當天用完；最后要認真閱讀疫苗使用說明書，嚴格按要求的免疫方法、部位、劑量等進行免疫。
　　除以上的細節外，廣州市益豚豬業投資有限公司副總經理黃少彬認為，疫苗注射部位的深度也要把握好。“疫苗要注射到肌肉中，假如注射到肥膘內則不易吸收，或吸收緩慢，吸收不完全，極易引起發炎發熱，導致牲畜不良反應。”黃少彬介紹，最好使用12號稍微長一點的針頭，進入深部肌肉，注入疫苗速度稍慢，防止疫苗由于注射速度過快、抽針太快而倒流，致使家畜注射部位紅腫、產生炎癥，影響注射效果。必須要求注射時確保一畜兩顆針頭，一針一棉球，防止交叉感染。