消毒藥按作用水平分為高效、中效、低效三類。高效消毒藥對病毒、細菌、芽孢、真菌等都有效，如戊二醛、氫氧化鈉、過氧乙酸等，但它們的副作用較大，對有些消毒不適用;中效消毒藥對所有細菌有效，但對芽孢無效，如乙醇、碘制劑等;低效消毒藥屬抑菌劑，對芽孢、真菌、親水性病毒(非囊膜病毒)也無效，如季胺鹽類等。

　　目前，規?；i場的病原微生物多重感染或繼發感染十分普遍，既有病毒的混合感染，也有細菌的混合感染，還有病毒和細菌的混合感染，以及存在一些原發性感染情況下出現繼發感染。

　　據調查，規?；i場存在著豬繁殖與呼吸綜合征病毒、豬圓環病毒2型、口蹄疫病毒、豬瘟病毒、偽狂犬病毒、肺炎支原體、豬鏈球菌、胸膜肺炎放線桿菌、巴氏桿菌、豬附紅細胞體、大腸桿菌等病原微生物的威脅。

　　選擇消毒液時，要根據消毒對象、目的、疫病種類，調換不同類型的藥物。如有些病毒(結構中無胞漿膜病毒)對普通消毒藥不敏感，特別是圓環病毒，一般消毒藥對它不起作用，應選擇高效消毒藥。(可選用復合酚，過氧乙酸。)對帶豬消毒，刺激性大，腐蝕性強的消毒藥不能使用，如氫氧化鈉等，以免造成人畜皮膚等處傷害;(可選用戊二醛癸甲溴銨，聚維酮碘溶液)。對注射部位消毒可選擇中效消毒藥等。

　　由于病原微生物本身的形態結構及代謝方式等生物特性的不同，其對消毒表現的反應也不同。如G+菌比G-菌對消毒藥更敏感，原因是G-菌細胞壁由豐富的類脂包膜形成，有阻止消毒藥進入的作用。

　　所以，對G-菌(如多殺性巴氏桿菌、沙門氏菌、胸膜肺炎放線桿菌等)需選擇作用較強的消毒藥。對具有芽孢的細菌(如炭疽桿菌)，因芽孢有較厚的芽孢壁和多層芽孢膜，結構堅實，消毒藥不易滲透進去，一般也應選擇高效消毒藥。

　　根據病原對特定消毒劑的敏感性來選擇消毒劑

　　豬瘟病毒對堿性消毒藥敏感，如火堿、生石灰，冬季可用2%的火堿溶液加5%的鹽水進行消毒。

　　口蹄疫病毒對酸性、堿性消毒劑都敏感，如火堿等。強烈推薦煤焦油酸、過氧乙酸。

　　藍耳病毒對醛類消毒劑(甲醛、聚甲醛等)、含氯消毒劑(5%的漂白粉溶液)、堿類制劑(氫氧化鈉和生石灰等)敏感。