近日，由中國農業科學院特產研究所李光玉研究員帶領創新團隊在國際上首次破譯鹿科動物全基因組序列。馴鹿全基因組測序的完成，不僅為研究人員從基因組水平挖掘馴鹿生長、代謝和抗寒等重要性狀的分子機制提供了科學指導，而且為馴鹿馴化歷史、基因組演化、群體遺傳及鹿類動物的進化等理論研究奠定了重要基礎。相關研究成果于11月1日在線發表在《GigaScience》上。

我國是鹿類動物資源最為豐富的國家，分布約有20種鹿類動物，而馴鹿是最具代表性的鹿科動物之一，是鹿科物種中唯一被馴化、雌雄個體均生長鹿角的鹿科動物。

鑒于該物種獨特的生物學特征和重要的科研價值，特產所特種動物營養與飼養創新團隊的研究人員，對一只雌性馴鹿進行了全基因組測序并獲得了高質量的組裝序列，基因組大小為2.64 Gb, Contig N50和Scaffold N50分別為89.7kb和0.94 Mb；基于同源比較和從頭預測的方法，注釋得到了21,555個蛋白編碼基因、159個rRNA、863個tRNA、547個miRNA和1,339個snRNA。系統發育分析表明馴鹿與?？莆锓N的分化時間大約在2950萬年，進一步的比較基因組學分析識別了335個馴鹿所特有的基因家族。

該項研究得到了中國農科院科技創新工程和國家自然科學基金等項目的資助，研究成果在線預發表期間即受到了廣泛關注，并且榮獲第十二屆國際基因組大會GigaScience前沿研究獎。據了解，該團隊目前為國際上鹿類動物消化道微生物組研究成效最為突出的研究團隊。近5年來，團隊先后系統性地研究了梅花鹿消化道微生物組的定植與演替規律，闡明了宿主-日糧-瘤胃微生物組三者之間的互作響應機制，相關論文發表在《環境微生物學報告（Environmental Microbiology Report）》《微生物生態（Microbial Ecology）》《BMC微生物學（BMC Microbiology）》及《科學報告（Scientific Reports）》等國際期刊上，得到了國內外同行的廣泛關注。

特產所李志鵬助理研究員等為本文共同第一作者，李光玉研究員和西北工業大學王文教授為共同通訊作者。