這些高流量的散毒和低劑量的感染，需要重新強調正確清潔在減輕PEDV傳播中的關鍵作用。下面總結一些出版的相關研究豬流行性腹瀉病毒的生存和消毒。額外的研究正在進行中，這樣的信息將繼續增長。對消毒劑的一般檢查，請審查“四個步驟，以達到有效的清潔和消毒。”

當審視消毒的效果的時候，要記住重要的是，目前確認感染PEDV的最好方式是豬的生物測定。PCR技術是一種高度敏感和偉大的技術，但不幸的是它檢測到遺傳物質(DNA或RNA)，并沒有區分感染性的和非感染性的材料。換句話說，消毒劑可以殺死或滅活豬流行性腹瀉病毒，但是仍有遺傳物質留下進行PCR技術檢測。例如，Radke等人，(2016)表明經過清洗、消毒和空舍10天，其75%的環境拭子PCR檢測仍為PEDV陽性，但斷奶仔豬放在圈舍后，這段時間沒有任何豬流行性腹瀉的臨床癥狀。對PEDV感染豬的生物檢測，也優于細胞培養檢測，細胞檢測不敏感，會被糞便樣品所影響，還可能會在細胞培養中存在破壞細胞的消毒劑。

需要注意的是，2014世界動物衛生組織(動物健康世界衛生組織)的報告總結PEDV對福爾馬林(1%)、無水碳酸鈉(4%)、脂溶劑、磷酸碘仿(1%)和氫氧化鈉(2%)比較敏感。

本文強調目前的資料關于PEDV在糞便中的生存能力以及不同消毒報告的有效性。重要的是要記住，這種特殊的病毒是散毒的數量非常大的和感染劑量是非常小的，因此，清潔和消毒的做法，必須正確徹底，以防止疾病傳播。在沒有消毒劑，高溫(≥71攝氏度至少10分鐘)或更長的時間(室溫≥7天)可用于抑制污染鋁掛車表面的病毒。