臨床癥狀與病理變化  
    1.臨床癥狀　腸毒綜合癥在蛋雞產蛋上升期和高峰期最易發生，由于該病雖然影響生長發育和產蛋性能，但引起的死亡率并不是特別大，所以往往被人們所忽視。有的養殖戶由于對本病的認識不足，誤認為是雞種或飼料原因而沒有及時治療，造成雞群產蛋性能表現不佳；或因雞群體質下降導致其它疫病的繼發感染而造成更大的經濟損失。
  腸毒綜合癥是一種由多病因引起的以腹瀉，過料，且糞便中含有血絲樣，西紅柿樣糞便為特征的腸道疾病，他不是單純的一種病原體引起的，而是由多種致病原共同作用的綜合性病癥。該病一年四季均能發生，但以夏、秋、冬季及氣候和溫差變化大的時候發生較多。以前該病多見肉雞，青年蛋雞偶有發生。近年來產蛋雞感染該病越來越普遍，并且發病率逐年呈上升趨勢。
腸毒綜合癥在蛋雞產蛋上升期和高峰期最易發生，由于該病雖然影響生長發育和產蛋性能，但引起的死亡率并不是特別大，所以往往被人們所忽視。有的養殖戶由于對本病的認識不足，誤認為是雞種或飼料原因而沒有及時治療，造成雞群產蛋性能表現不佳；或因雞群體質下降導致其它疫病的繼發感染而造成更大的經濟損失。
  2.病理變化
        剖檢發現胸肌、腿肌萎縮脫水。肝、脾腫大、出血，肝實質脆弱易碎，肝表面有散在的灰黃色或暗紅色出血。其主要病變在腸道，尤其在小腸，發病初期，十二指腸、空腸的卵黃蒂之前的部分腸黏膜增厚，顏色變淺，呈灰白色，似一層厚厚的麩皮，極易剝離；腸壁也增厚，腸腔空虛，內容物較少，時而見到一些未消化的飼料。嚴重的在小腸中后段充滿橘黃色的柿子樣、魚腸樣或胡蘿卜樣物質。
        發病的中后期，腸壁變薄，腸黏膜脫落，腸內物呈蛋清樣、粘膿樣或柿子樣，腸壁上有潰瘍狀壞死灶，腸內充滿泡沫樣液體。部分病例大腸壁上壞死灶凹陷達到黏膜肌層，甚至引起腸壁穿孔，形成腹膜炎和腸黏連。病程稍長的病例，腸內容物呈淡黃色或污紅色，腸壁上散有土黃色大小或形狀不一的麩皮樣壞死灶。卵泡發育不整齊，成熟和未成熟卵泡偏少，輸卵管內有星狀出血點，并有少量豆腐渣樣分泌物，輸卵管腫脹，彈性較差，子宮部黏膜增厚水腫并有出血現象。
          小腸球蟲的感染
   由于小腸球蟲在腸粘膜上大量生長繁殖，導致腸粘膜增厚，嚴重脫落及出血等病變、幾乎使飼料不能消化吸收，同時，對水分的吸收也明顯減少，盡管雞大量飲水，也會引起脫水現象。這是引起蛋雞糞便變稀，糞中帶有沒消化的飼料的原因之一。是產蛋因飼料消化吸收不良出現下降的原因，包括蛋殼色澤變陳舊的原因。
            腸道內環境的變化
      大量的實驗資料表明：在小腸球蟲感染的過程中，小腸球蟲在腸粘膜細胞里快速裂殖生殖，因球蟲的大量增殖需要消耗宿主細胞的大量氧，導致小腸粘膜組織產生大量乳酸，使得雞腸腔內PH值嚴重降低。由于腸道PH值的改變，腸道菌群發生改變，有益菌減少，有害菌大量繁殖，特別是大腸桿菌、沙門氏茵、魏氏梭菌等趁機大量繁殖，球蟲與有害菌相互協同，加強了致病性。
        腸道內容物pH值的下降，會使各種消化酶的消化能力下降，飼料消化不良，另外，PH值的下降，會刺激腸道粘膜，使腸的蠕動加快加強。消化液排出增多，飼料通過消化道的時間縮短，消化時間減少，導致飼料消化不良。由于腸的蠕動加快加強，膽囊分泌的膽汁迅速從腸道排出，與沒消化的飼料混合在一起，形成該病的特征性糞便——略帶淺黃色的糞便。
飼料中維生素、能量和蛋白質的影響
調查中發現，飼料營養越豐富，發病率越高，癥狀也越嚴重，品質較低的飼料相對發病率較低。這是因為，在球蟲與細菌的混合感染中，大量的能量、蛋白質和部分維生素促進二者大量繁殖，加重癥狀。
         自體中毒
    在發病的過程中，大量的腸上皮細胞破裂，在細菌的作用下，發生腐敗分解，以及蟲體死亡、崩解等產生大量有毒物質，被機體吸收后發生自體中毒。從而在臨床上出現產蛋下降部分雞先興奮不安，后癱軟昏迷衰竭死亡的情況。