養殖場污染治理方法很多，但要考慮處理方法的技術優點、投資、日常運行費用和操作管理是否方便等因素，目前應用最廣泛的是生物處理法，即主要通過微生物的生命過程把污水中的有機物轉化為新的微生物細胞以及簡單形式的無機物，從而達到去除有機物的目的。

1，采用“干清糞”工藝減少沖洗用水

用水沖洗豬舍顯然省時、省力又衛生，但糞、尿和水混合后造成后處理量大而復雜，須經過沉淀、過濾，反而事倍功半，并且浪費寶貴的水資源。實驗表明采用水沖糞和干清糞不同的清糞工藝，每頭豬的年均用水量分別為35～40t、10～15t。因此，應提倡推廣干清糞工藝，即糞尿分離，及時清糞，既有利于糞污處理，又可減輕對豬體本身的污染以及臭氣的散發。

2，完善工藝流程，加強科學管理養殖場的能源環境工程

必須依據《畜禽養殖業能源環保站設計規范》的要求做好前處理、厭氧處理和后處理的設計和施工，工藝要精良，技術要先進，容量要配套，管理要科學，還要特別注意發揮前處理投資省、效果好、管理方便的作用。

3，提高養殖水平，減少污染物排放量。

首先要改善日糧配方和飼料加工工藝，糞便污染的實質在于日糧中營養物質吸收不完全而殘留有N、P、C和一些重金屬如Cu、Zn等。從營養學的角度考慮，畜禽可視為一個生產系統:“輸入(飼喂)－轉化(消化)－輸出(糞尿)”，要使末端達到最小而不影響中間，只能著手于減少始端的供給量，形成“兩頭小中間大”的狀態。其次要合理使用飼料添加劑，在飼料中添加一定比例的微生態制劑、酶制劑、中草藥、礦物質等，不僅能提高飼料轉化率、有利于畜禽健康，而且能減少有害物質的排放、減輕養殖場惡臭。但添加的比例一定要合適，否則會造成畜禽產品的品質下降和環境污染加劇。

4，積極開展糞污的綜合利用。

糞污不是垃圾，而是放錯了地方的資源，充分研究和利用糞污不僅可減緩全球資源危機和環境危機，還能帶來可觀的經濟效益和社會效益。(1)還田肥土或生產有機肥用于農業生產。(2)發展生態型農牧業。

5，積極開展沼氣綜合利用。

在未來的能源生產中，沼氣將扮演越來越重要的角色，在生產沼氣的同時，利用和處理了大量糞便和生活垃圾，沼氣時代不是過時了，而是還沒有到來。沼氣可用于養殖場的職工生活用能、仔豬保溫、發電等，是最廉價、最環保的能源。目前沼氣的綜合利用率低，許多沼氣沒有得到利用就被直接排放到空氣中，還造成嚴重的溫屋氣體效應(CH4造成溫屋氣體效應是CO2的21倍)。同時要大力發展農村戶用沼氣，保護森林資源。