在對抗傳染性疾病時，第一步是正確地識別致病原，以及在宿主上引起的癥狀和損傷。

一個正確的診斷會影響現有的治療效果，特別是如果采用預防措施如接種疫苗。

傳統的技術如顯微鏡觀察和卵囊計數都是非常有用的篩選方法，且有助于動物上球蟲病的診斷和治療。

但是，DNA為基礎的方法克服了傳統方法的一些限制，能在短時間內測定更多的樣本，靈敏度增加，而且能一步定量寄生蟲。