消化道疾病是雞的常見病，一般的癥狀包括腹部下垂，嘔吐，反逆，體重下降，精神不振及下痢。大部分的消化道疾病與雞舍的飼養管理，環境，個體免疫力，營養失調，飼養過于密集有關。雞嘔吐的原因包括腺病毒、念珠菌、沙門氏菌、吸蟲的感染以及嗉囊炎與中毒。雞眼睛、口腔及鼻若有分泌物可能造成的原因有單眼傷風綜合感染、念珠菌及滴蟲感染。

1咽

對病雞的咽部進行完整的檢查，觀察雞咽喉黏膜的顏色，正常的黏膜是濕滑、紅潤、平滑，如果雞出現紅腫、發炎、長白色的結節等病征，其原因可能是念珠菌癥、呼吸道慢性感染、維生素A缺乏、雞痘、腫瘤、毛滴蟲、外傷等。念珠菌癥發生原因很多，例如雞舍的飼養環境太差，雞舍溫度、濕度太高，濫用抗生素，營養失調，腸內有寄生蟲，雞的飼養過于密集，這些因子都會造成白色念珠菌大量增殖而發病，所以白色念珠菌的感染是二次性感染，常與毛滴蟲、病毒性疾病共同發生而造成病雞的死亡。念珠菌癥的診斷可以綜合病雞的臨床癥狀，剖檢病變，近期的病史，用藥史，一般的顯微鏡檢查來確診。

維生素A缺乏是較常忽略的疾病，只要雞飼料營養不均衡就會造成維生素缺乏，因雞體內無法自己制造維生素A，需要靠外來的飼料補充。其主要功能是維護雞上皮細胞的正常發育和生長。由于雞上消化道的的黏膜是上皮細胞，所以維生素A缺乏會造成病雞口腔、食道、嗉囊、咽喉等黏膜的組織發炎、化膿等病變，易受到其他的二次性病原的感染。

2食道

雞食道常見的問題包括發炎、外傷、嗉囊炎。甲狀腺細胞增生或是腫瘤，雞腫瘤性疾病相當常見，腫大的硬塊會壓迫食道而造成雞在進食或是消化時出現障礙。此外鉛中毒或是食物中毒也會損傷食道。

黃曲毒素中毒主要是雞長期或是過量食入含有黃曲毒素的飼料而引起，長時間蓄積后便會發病。尤其是玉米久存，易因黃曲菌生長所產生的有毒代謝產物，在食物及飼料中以毒素B1的毒性最大，可侵害人、畜、禽的肝，影響肝功能及消化機能。中毒的程度隨雞的日齡大小及攝入量的不同而不同，雛雞的敏感度較高。雞在臨床上表現為食欲不振，下痢，體質瘦弱，伴有貧血現象，病情發展很慢。急性中毒常發生在雛雞，中毒時雞不食，容易嘔吐，嗜睡，生長發育慢，下痢，排白色或綠色稀糞。剖檢可見急性中毒的患雞肝腫大，色變淡，胃腸充血或出血。慢性中毒者出現膽管增生、肝硬化等情況。

3嗉囊和胃

嗉囊包括最常見的腫瘤、灼傷、穿孔。雛雞或是幼小的鳥類其嗉囊比較脆弱，其嗉囊較易受傷。胃常見的的問題包括發炎、異物性阻塞或潰瘍等疾病。

4腸

若雞的小腸出現問題，其最常見的的癥狀是下痢。病雞的糞便可呈水樣、白色、綠色、粘液狀、血痢、含有食物渣等。雛雞的下痢造成原因有披衣菌、球蟲病、大腸桿菌感染，輪狀病毒及腺病毒的感染。
①出血性糞便。血痢的原因很多，例如最見的是泄殖腔脫垂、急性鉛中毒、肝疾病、腸道出血、沙門氏菌的感染、梭狀桿菌感染、球蟲病、吸蟲、毛細樣線蟲等，鏡檢可查到球蟲蟲卵。雞食物中毒也會排血便，還會出現出血，呼吸困難，體溫下降等情。
②白色糞便。細菌性白痢的雞排白色糊狀糞便，弓蟲感染的雞會排白色糞便，出現神經癥狀包括角弓反張，歪頭和眼睛失明等癥狀。
③綠色下痢糞便。鉤端螺旋體感染，臨床癥狀表現為貧血、黃疸等。雞銅中毒時則呈排深綠色糞便，腦有充血、出血、水腫等癥狀。
④水樣下痢。當病雞出現六鞭毛蟲感染、細菌感染如雞副寒、食物中毒等情況明常水樣下痢。

5其他消化道疾病的檢查

外觀癥，完整的檢查雞外觀包括口腔、眼睛、鼻孔是否有分泌物，可用手去觸摸腹部是否有硬塊?？谇?，以棉花棒采取，抹片以顯微鏡檢查?？谇话ㄉ项€咽喉部可檢查毛滴蟲、念珠菌、炎癥細胞、細菌相及微漿菌等。糞便，糞便的顏色、形狀可做初步的檢查，檢查各種蟲卵或是卵囊、吸蟲卵、絳蟲節片、滴蟲及細菌及微漿。細菌學，糞便抹片經特殊染色可初步確診部份細菌的種類。血液，檢查血液寄生蟲、沙門氏菌、披衣菌或單眼傷風或是雞貧血等。放射學檢查，身體各器官例如肝有異物、腫瘤、腸道阻塞、卵巢炎或是卵太大等情況。腹腔內視鏡查，可檢查雞體內各臟器的疾病，協助疾病的診斷。