為了給新入雞群在飼養過程中創造一個良好的干凈舒適的環境，清除以往雞群和外界環境中的病原體。消毒效果的好壞，直接影響到雞群的健康，所以空置雞舍消毒顯得尤為重要。

第1天清掃

首先應清除舍內的墊草垃圾、糞便、羽毛等廢棄物(可以事先用消毒液噴灑，避免病原微生物隨糞塵飛揚)。并將地面、門窗、屋頂等地方的灰塵清掃干凈。

第2天水洗

在水中加入堿性藥物后對養殖場的墻壁、地面、籠架、用具進行清洗，使用高壓水槍沖洗效果更好。尤其要注意對角落的清洗。

第3天干燥

等清洗時留下的水分干燥后再進行消毒，消毒液不被稀釋，可保證消毒效果。

第4天 消毒

用消毒藥噴灑或浸泡消毒用消毒藥噴灑墻壁、門窗、頂棚、籠架等，料水槽能拿的可放到大容器內用后悔消毒劑刷凈，用清水沖洗干凈，晾干備用;籠養的，要用消毒液反復擦洗料槽。

第5天 干燥

第6天 再消毒

為殺滅球蟲卵囊，在床面、排水溝等處，追加噴灑殺球蟲卵囊藥物。若是遇到墻壁、地面、籠架及不怕燒的用具可以使用火焰槍對其表面進行消毒，速度為每分鐘2平方米。

第7天 干燥

第8天 熏蒸消毒

一般經過15天后再檢測消毒效果，用瓊脂平板取菌法。確定消毒達標后做進雞準備，開始新一輪的生產。消毒作業時，對搬出舍外的用具等，須在指定的場所進行水洗和消毒;糞便及墊料等應深埋、焚燒或發酵處理。

注意：

①雞糞和污物等有機物，有機物減弱消毒消毒，須將其清除、洗凈后才能發揮后續消毒作用。

②需將舍門及其他所有縫隙封嚴，避免泄漏蒸氣，以充分發揮煙霧彈熏蒸消毒的作用。

③對空閑雞舍的消毒，有時可不必按雞舍消毒作業程序逐項進行操作，可根據雞舍條件、衛生狀況等，適當地簡化處理程序。

④使用的消毒劑不能隨意混合，防止彼此會發生拮抗作用。消毒可以輪換使用，免得產生抗藥性。

⑤一般熏蒸消毒后要空幾天后再進雞，如果空舍1個月以上再進雞還要再次熏蒸消毒，用藥量按一級消毒來進行。