種雞場定期做疫病凈化，可減少雞群患病幾率，減少養殖成本。不過在做疫病凈化時，養殖戶需注意以下幾項凈化事項。
    l.合理布局，全進全出
　　種雞場應建在地勢高燥、排水方便、水源充足、水質良好，離公路、河流、村鎮(居民區)、工廠、學校和其他畜禽場至少500米以外的地方。特別是與畜禽屠宰、肉類和畜禽產品加工廠、垃圾站等距離要更遠一些。同時要做到場內布局合理，飼養時全進全出。
　　2.重視飼料質量和飲水衛生 應定期對本場的水質進行檢測，可在雞舍的進水管上安裝消毒系統，按比例向水中加入消毒劑。用于水的消毒藥常用的有次氯酸鈉、威島牌消毒劑等。最好是改水槽飲水為乳頭飲水器飲水，以防飲水暴露在空氣中而受到污染。
　　3.重視環境的治理
　　在重視外部環境治理的同時，應定期對雞舍內環境進行監測，發現問題，及時采取措施解決。定期進行帶雞消毒，不但可以殺滅雞舍內病原微生物，還能夠降低舍內灰塵，保持舍內空氣清新，所以，堅持帶雞消毒在很多雞場已成為必須遵守的工作程序。雞的許多傳染病能夠通過空氣傳播，故對種雞舍的通風應有嚴格要求。種雞應采用密閉飼養，縱向通風，原種雞場應采用正壓過濾通風。
　　4.重視種蛋消毒
　　為防止雞白痢、霉形體病、淋巴白血病、大腸桿菌病、葡萄球菌病等的傳播，首先要保持產蛋箱的清潔衛生，定期消毒，減少種蛋的污染。窩外蛋、破蛋、臟蛋一律不得作為種蛋入孵。被選蛋放入種蛋消毒柜內用42mL/m3的福爾馬林熏蒸消毒30分鐘；然后送入孵化廳(室)定期進行消毒。
　　獸醫人員對種蛋和孵化過程中的每個環節定期采樣監測消毒效果。采用人工授精的種雞場要特別注意人工授精所用器具一定要嚴格消毒，輸精時要做到一雞一管，不能混用。
　　5.堅持種雞疾病凈化工作
　　為了保證種雞的健康，雞場在引種時一定要了解供種的雞場是否有傳染病，雞場的防疫衛生及疾病凈化水平如何，這些都了解以后再決定是否從這個種雞場引種。引種時要把品種優良、健康無病的種雞引進本場，否則將后患無窮。種雞場除了做好一般的衛生防疫工作以外，還要做好經蛋傳遞疾病的凈化工作。即使從國內外凈化水平很高的種雞場引種，也要堅持檢疫凈化。有的種雞場不愿意在種雞的檢疫凈化上投入力量，檢出的陽性雞也舍不得淘汰，結果種雞的成活率和產蛋率受很大影響，向社會上提供的雛雞死亡率很高，種雞場的聲譽不好，效益自然也不會好。
　　6.做好種雞群的免疫工作
　　種雞和商品雞在免疫方面有相同的地方，也有不同之處。種雞的免疫不僅要通過免疫使本場的種雞得到保護，還要讓雛雞對一些主要傳染病有抵抗力。這對于提高雛雞的成活率有重要意義。為達到這一目的，種雞在雛雞和育成階段，主要用弱毒苗免疫，18～20周齡時注射油乳劑滅活苗，有的病(如傳染性法氏囊炎)在40周齡時還要進行一次滅活苗加強免疫。