化學消毒劑種類繁多，性質各異，它們的殺菌水平也不相同。根據其殺菌能力的強弱，可將化學消毒劑分為高水平、中等水平和低水平三個級別。養雞場的病菌多，一般使用高水平的化學消毒劑為好。在選用消毒劑時應注意以下問題：
　　1.根據所要消毒的微生物選擇消毒劑，如要殺滅細菌芽孢或無囊膜病毒，必需選用高效消毒劑(過氧乙酸、火堿、醛類、碘伏、有機氯制劑、復方季銨鹽消毒劑等)。
　　2.消毒藥不能隨意混合使用，酚類、醛類、氯制劑等不宜與堿性消毒劑混合，陽離子表面活性劑(新潔爾滅等)不宜與陰離子表面活性劑(肥皂等)混合。
　　3.要有足夠的消毒劑量，消毒劑量是殺滅微生物的基本前提，它包括消毒強度和消毒時間兩個方面，化學消毒劑的消毒強度指消毒劑濃度，增加濃度相應進步消毒速度，消毒作用加強，但濃度也不宜過高，過高的濃度往往對消毒對象利，有的還有侵蝕性、刺激性，同時盲目增加濃度反而造成不必要的鋪張。另外減少消毒時間會降低消毒效果，但濃度降低至一定程度，即使再延長消毒時間也達不到消毒目的。假如污染的微生物數目較多，如嚴峻污染的物品、場地，應提高前輩行衛生清潔工作，并適當加大消毒劑的用量和延長消毒時間。
　　4.溫度和濕度，通常溫度升高消毒速度會加快，增加藥物滲透滲出力，明顯進步消毒效果。很多消毒劑在溫度低時反應速度緩慢，甚至不能施展消毒作用，如福爾馬林在室溫20度以上消毒效果非常好，在室溫15度以下消毒效果不好。濕度對熏蒸消毒的影響較大，甲醛、過氧乙酸熏蒸消毒時濕度要求在60%-80%，另外大部門消毒劑在干燥后就失去消毒作用，溶液型消毒劑在用液中才能有效的施展作用。
　　5.酸堿度，病原微生物相宜生長PH值在6-8之間，過高或過低的PH值有利于殺滅病原微生物，另外PH值影響良多消毒劑的消毒效果，如酚類、氯制劑、碘制劑等在酸性前提下殺菌力強，新潔爾滅等在堿性前提下殺菌力強。
　　6.有機物質的存在，在消毒環境中常有畜禽分泌物、糞便、膿液、飼料殘渣等各種有機物，會嚴峻消耗消毒劑，降低消毒效果。原因主要是：有機物籠蓋在病菌表面，妨礙消毒劑與病菌直接接觸而延遲消毒反應;部門有機物可與消毒劑發生反應天生溶解度更低或殺菌能力更弱的物質，甚至產生的不溶性物質反過來與其它組分一起對病原微生物起到機械保護作用;消毒劑被有機物所消耗降低了對病原微生物的作用濃度。氯制劑、單純季銨鹽類、過氧化物類等消毒作用顯著受有機物影響、碘伏類消毒劑則受有機物影響就比較小些。